软件最大的亮点在于改变了人们进行层序地层学研究的传统方式。一般进行层序地层学研究都是先进行全区域的层位解释，得到层位后再建立地质模型，从而对层序的演变进行分析。PaleoScan软件是通过数学算法，直接从整个地震数据体中计算得到地质模型，然后从模型中提取层位，然后进行地层学及层序结构分析。
但是，它又不仅仅是在做数学游戏，在计算地质模型的过程中，已有的层位及断层数据可以作为约束条件来使模型的计算更符合地质认识。也就是说赋予了地质人员一个非常快捷方便的工具，将地质人员从繁重的地震层位追踪解释中释放出来，从而有更多的精力进行整个地层层序的研究。
并且PaleoScan软件提供的算法并不等同于很多地震解释软件中的层位自动追踪，它是以整个地震数据体为计算对象，使用一种基于地震数据相似性及地质一致性的价值函数，用最优化分析的思想对地震数据体进行空间解构，从而将地震数据体整体转化为地质模型，而层位在模型的计算过程中就已经生产了。
井数据在PaleoScan软件中的作用是与地震解释数据互相标定与修正的作用，它们之间快捷有效地交互式分析可以使不同尺度的信息更好地融合起来。
1. 快速，方便。大大节省层序地层学研究的时间。
2. 合理的算法避免了地震资料质量及地质环境因素等带来的局限性，也减少了解释人员所带来的人为误差。
3. 改变了传统层序地层学研究的流程，对地震资料的应用更加充分。
4. 将已有解释数据、地质认识、井数据等约束条件与数学算法有效地结合起来，缩短了层序地层学的研究过程，使整个研究工作更有效率。
5. 在模型计算等模块中，设有TEST功能，选取一个范围进行参数实验，效果满意后再进行整体运算，避免了重复运算和资源浪费。

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